O Instituto de Matemática e Estatística da USP é responsável por 6 cursos de graduação:
- Bacharelado em Ciência da Computação (integral)
- Bacharelado em Estatística (integral)
- Bacharelado em Matemática (integral)
- Bacharelado em Matemática Aplicada e Computacional (integral e noturno)
- Licenciatura em Matemática (matutino e noturno)
Todos os cursos são reconhecidos entre os melhores de suas áreas no país e formam profissionais de destaque.
Além disso, o IME é responsável pelo oferecimento das disciplinas nas áreas de Ciência da Computação, Estatística, Matemática, e Matemática Aplicada a vários cursos do campus Butantã da USP.