Fone: (11) 3091-6495

Sala: 220 - CCSL

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Educação e Títulos Acadêmicos

Livre docência, Instituto de Matemática e Estatística da USP, 2010.

Pós Doutorado, Texas A M University, TAMU, Estados Unidos, 2003.

Doutorado, Ciência da Computação, Instituto de Matemática e Estatística da USP, 2000.

Mestrado, Ciência da Computação, Instituto de Matemática e Estatística da USP, 1994.

Graduação em Física, Instituto de Física da USP, 1988.

 

Cursos que costuma lecionar

Estrutura de Dados; Introdução à Computação; Álgebra Booleana e Aplicações; Reconhecimento de Padrões I; Aprendizagem de Máquina; Bases da Morfologia; Matemática para Análise de Imagens; Visão e Processamento de Imagens; Introdução a Redes Booleanas Probabilísticas; Princípios de Desenvolvimento de Algoritmos.

 

Principais prêmios recebidos ao longo da carreira

Prêmio de melhor Poster (Shortest Paths Ranking Methodology to Identify Alterations in PPI Networks of Complex Diseases), ACM Conference on Bioinformatics, Computational Biology and Biomedicine (ACM-BCB 2012).

10 melhores dissertações de mestrado em Ciência da Computação (como orientador), XXII Concurso de Teses e Dissertações da SBC (CTD 2009).

Terceiro Lugar na Olimpiadas USP de Inovacao, Agencia USP de Inovaçao.

Prêmio de melhor Poster (Considerations on Using COD for Inference of Gene Regulation Networks), The 4th International Conference of The AB3C (XMeeting 2008).

 

Publicações selecionadas

1. Higa, Carlos HÁ; Louzada, Vitor HP; Andrade, Tales P; Hashimoto, Ronaldo F. Constraint-based analysis of gene interactions using restricted boolean networks and time-series data. BMC Proceedings, v. 5, p. S5, 2011.

2. MARTINS, D. C.; BRAGA-NETO, U.; BITTNER, M. L.; HASHIMOTO, R. F.; DOUGHERTY, E. R. Intrinsically Multivariate Predictive Genes. IEEE Journal of Selected Topics in Signal Processing , v. 2, p. 424-439, 2008.

3. HASHIMOTO, R. F.; KIM, S.; SHMULEVICH, Ilya ; ZHANG, Wei; BITTNER, M. L.; DOUGHERTY, E. R. Growing Genetic Regulatory Networks from Seed Genes. Bioinformatics (Oxford), Grã-Bretanha, v. 20, n.8, p. 1241-1247, 2004.

4. HASHIMOTO, R. F.;BARRERA, J. A Note on Park and Chin´s Algorithm. IEEE Transactions on Pattern Analysis and Machine Intelligence , v. 24, n.1, p. 139-144, 2002.

5. HASHIMOTO, R. F.; BARRERA, J.; FERREIRA, C. E. . A Combinatorial Optimization Technique for the Sequential Decomposition of Erosions and Dilations. Journal of Mathematical Imaging and Vision , v. 13, p. 17-33, 2000.

 

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