Métodos estatísticos aplicados às Ciências Biológicas (MAE5755)

Julio da Motta Singer (sala A202)
Denise Aparecida Botter (sala A203)
Horário: 2a feira das 10:00h às 11:40 e 5a feira das 8:00 às 9:40
Link para sala virtual: http://meet.google.com/yaa-uxso-dbb (Entrar com e-mail usp; em caso contrário será necessário pedir autorização)
Monitor: Felix Lopes Barboza (felixbarboza@ime.usp.br)
Atendimento: 5a feira durante a aula

  • Programa

1. Introdução

* Estatística descritiva e inferência estatística
* Definição e codificação de variáveis
* Organização de bancos de dados
* Ordem de grandeza, precisão e arredondamento de dados quantitativos
* Proporções e porcentagens
* Taxas e números índices

2. Representação gráfica e tabular de distribuições de frequências

* Tabelas de frequências
* Gráficos de barras e de pizza
* Histogramas
* Construção e apresentação de gráficos e tabelas

3. Medidas resumo

* Medidas de posição (média, mediana, moda e percentis/quartis)
* Medidas de dispersão (Variância, desvio padrão, amplitude, intervalo interquartílico)
* Gráficos do tipo caixa (“box plots”)

4. Associação entre variáveis

* Tabelas de contingência
* Risco relativo e razão de chances
* Sensibilidade e especificidade
* Tabelas de médias e desvios padrões
* Gráficos de perfis de médias
* Gráficos de perfis individuais
* Gráficos do tipo QQ
* Gráficos de dispersão
* Correlação linear

5. Noções sobre inferência estatística

* Modelos probabilísticos
* Estimação pontual
* Intervalos de confiança
* Testes de hipóteses
* Cálculo do tamanho de amostras

6. Modelos estatísticos e análise inferencial

* Análise de tabelas de contingência
* Regressão linear
* Análise de variância
* Regressão logística
* Análise de sobrevivência

7. Planejamento de estudos experimentais e observacionais

* Determinação do objetivo do estudo
* Determinação do tipo de estudo
* Detalhamento do estudo
* Avaliação da proposta do estudo
* Avaliação da generalizabilidade dos resultados
* Condução do estudo

Bibliografia

* Agresti, A. (1995). Introduction to the analysis of categorical data. New York: Wiley.
* Altman, D.G. (1991). Practical Statistics for Medical Research. New York: Chapman and Hall.
* Bussab, W.O. e Morettin, P.A. (2014). Estatística Básica, 8a. edição. São Paulo: Saraiva.
* Daniel, W. (1999). Biostatistics: A foundation for analysis in the Health Sciences, 7th edition. New York: Wiley.
* Fisher, L.D. and Van Belle, G. (1993). Biostatistics - A methodology for the health Sciences. New York: Wiley.
* Hosmer, D.W. and Lemeshow, S. (2000). Applied Logistic Regression, 2nd ed. New York: Wiley.
* Kleinbaum, D.G. (2005). Logistic regression, 2nd ed. New York: Springer-Verlag.
* Kleinbaum, D.G. and Klein, M. (2005). Survival analysis: a self-learning text, 2nd ed. New York: Springer-Verlag.
* Kleinbaum, D.G., Kupper, L., Mueller, K.E., and Nazim, A. (1997).Applied Regression Analysis and Other Multivariable Methods, 3rd.ed. Boston: Duxbury Press.
* Lee, E.T. (1992). Statistical Methods for Survival data Analysis, 2nd ed New York: Wiley.
* Magalhães, M.N. e Pedroso de Lima, A.C. (2013). Noções de Probabilidade e Estatística, 7a. edição. São Paulo: EDUSP.
* Marks, R.G. (1982). Designing a Research Project. Belmont, CA: Lifetime Learning Publications.
* Morettin, P.A. e Singer, J.M. (2020): Estatística e Ciência de Dados. (Versão parcial preliminar).
http://www.ime.usp.br/~jmsinger/MAE0217/cdados2021out12.pdf
* Kutner, M.H., Nachtsheim, C.J., Neter, J. and Li, W. (2005). Applied linear statistical models, 5th ed. Chicago, Illinois: Irwin.
* Rosner, B. (1986). Fundamentals of Biostatistics, 2nd ed. Mass: PWS Publishers.

Bibliografia complementar

* Altman, D.G., Gore, S.M., Gardner, M.J. and Pocock, S.J. (1983). Statistical guidelines for contributors to medical journals. British Medical Journal, 286, 1489-1493.
* Ehrenberg, A.S.C. (1981). The problem of numeracy. The American Statistician, 35, 67-71.
* Fienberg, S.E. (1979). Graphical methods in Statistics. The American Statistician, 33, 165-178.
* Haynes, R.B., Mulrow, C.D., Huth, E.J., Altman, D.G. and Gardner, M.J. (1990). More informative abstracts revisited. Annals of Internal Medicine, 113, 69-76.
* Koch, G.G. and Sollecito, W.A. (1984). Statistical considerations in the design, analysis and interpretation of comparative clinical studies. Drug Information Journal, 18, 131-151.
* Matos, F.G. (1988). O título de um trabalho científico: claro, conciso e criativo. Ciência e Cultura, 40, 778-779.
* Wainer, H. (1984). How to display data badly. The American Statistician, 38, 137-147.
* Woodford, F.P. (1967). Sounder thinking through clearer writing. Science, 156, 743-745.

Arquivos de dados

* Braga1998: http://www.ime.usp.br/~jmsinger/Dados/AMWBraga1998.xls
* Braga1998mod: http://www.ime.usp.br/~jmsinger/MAE5755/AMWBraga1998.modificado.xls
* Espirometria2014: http://www.ime.usp.br/~jmsinger/MAE5755/Espirometria.xls
* Espirometria2014R: http://www.ime.usp.br/~jmsinger/MAE5755/Espiro_curso.RData
* Colesterol: http://www.ime.usp.br/~jmsinger/MAE5755/Colesterol.RData
* Disco: http://www.ime.usp.br/~jmsinger/MAE5755/disco.xls

Material auxiliar

* Sugestões para construção de gráficos e tabelas: http://www.ime.usp.br/~jmsinger/Textos/Tabelasegraficos.doc
* Link para tutorial R: https://didatica.tech/curso-de-r-online-para-iniciantes/
* Função R para cálculo de medidas de associação em tabelas 2×2 (elaborada por Gustavo A. Ballen): https://gist.github.com/gaballench/da91607fe5f80de5a619
* Resumo: http://www.ime.usp.br/~jmsinger/MAE5755/GastroHepato2016.pdf

Listas de exercícios:

  1. Lista 1: Exercícios 2, 4, 5, 6 e 8 do Capítulo 2 de Morettin e Singer (2020ago24). Entrega (arquivo pdf) em 10/09/2020.
  2. Lista 2: Exercícios 2, 6, 12, 15, 16, 18, 21, 25, 28, 29, e 32 (opcional) do Capítulo 3 de Morettin e Singer (2020set13), justificando as respostas para os exercícios apresentados na forma de testes.
    Entrega (arquivo pdf) em 28/09/2020.
  3. Lista 3: Exercícios 1, 5, 10, 14, 15, 16, 19, 21 e 23 do Capítulo 4 de Morettin e Singer (2020set30), justificando as respostas para os exercícios apresentados na forma de testes.
    Entrega (arquivo pdf) em 15/10/2020.
  4. Lista 4:
  5. Lista 5:
  6. Lista 6

Observação: As listas devem ser necessariamente entregues em grupo. Os grupos estão definidos na planilha disponível em:
http://www.ime.usp.br/~jmsinger/MAE5755/Grupos.xlsx.

mae5755.txt · Last modified: 2021/10/12 09:37 by admin
 
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