Quando um problema acontece a primeira coisa que um usuário deve pensar é verificar o log do sistema para tentar encontrar mensagens do erro ocorrido. Os logs estão localizados no diretório /var/log neste diretório se encontra todos os logs do sistema, os mais importantes são: /var/log/syslog, /var/log/auth, /var/log/Xorg.93.log, /var/log/dmesg, /var/log/message e /var/log/kern.log. Se ocorrer um problema você deve examinar esses logs.
A primeira regra para evitar problemas é: Nunca se log como root para fazer tarefas de usuário comum. O usuário root é o administrador do sistema, ele tem permissão para apagar/modificar/copiar/instalar todos os arquivos, se você estiver logado como root e instalar um script malicioso terá um sistema comprometido.
Se você está conectado na Internet, é interessante rodar um firewall para controlar o acesso as portas do seu computador.
A maioria dos problemas acontecem por inexperiência dos usuários,