Lista de Discussão de MAC 5726 - Biologia Computacional

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Re: Curiosidade

Ola

Sem contar que muitos sequeciadores estao conectados
com Mac onde a interface se noa e otima e facil de se
utilizar

Abraco

Paulo



--- João Marcelo Pereira Alves <jotajj@usp.br> wrote:
> Seiji, 
>  
> você lembrou de um ponto muito importante. Concordo,
> uma vez que também 
> estou em um meio (quase) puramente Windows-cêntrico
> e com colegas que não 
> sabem nem acessar o prompt do MS-DOS, o que dirá
> compilar um código fonte 
> (por mais simples que isso seja pra quem se dispõe a
> ler alguns parágrafos 
> do README). Mesmo sendo usuário de Linux há uns 4
> meses e não tendo medo de 
> computadores, ainda assim eu também me sinto meio
> perdido às vezes. Então aí 
> vão algumas dicas de uns programas que acho que
> estão no caminho certo. Ou 
> que já são idênticos às versões às quais o "público
> alvo" está 
> acostumado... 
>  
> É legal ver que isso está mudando e que muitos
> destes programas pra Win 
> estão bastante bons em Linux, até mesmo a interface
> amigável. O Clustal 1.81 
> é idêntico à versão Win, o PHYLIP, o MOLPHY e o
> TreePuzzle também (que mesmo 
> no Win já são tipo linha de comando, portanto
> nenhuma novidade). O principal 
> pacote para montagem de genomas, o
> phred/phrap/Consed, é bastante tranqüilo 
> também, e a parte que exige manipulação pelo usuário
> é completamente gráfica 
> (Consed). Há também alguns programas de edição
> manual de alinhamento muito 
> simples de usar, como o SeaView. E um clássico da
> conversão de formatos, o 
> ReadSeq, também está disponível em versão Java, e
> funciona perfeitamente na 
> interface de janela. Já estão disponíveis também
> alguns programas para 
> manipulação e edição de árvores filogenéticas, mas
> estes ainda não testei 
> direito para dizer. 
>  
> Ou seja, hoje já há versões Linux bastante
> utilizáveis para pessoas vindas 
> do Windows. Depois que está tudo instalando e
> rodando (e nessa parte ainda 
> tem muito o que mudar pra essas pessoas se sentirem
> confortáveis), não há o 
> que temer. É só acostumar. 
>  
> Inté 
> J 
>  
> ------------------------------------------------- 
> João Marcelo Pereira Alves (J) 
> Dept. of Parasitology - Inst. Biomedical Sciences 
> f. 55 11 9608-3508 
> University of São Paulo - Brazil 
> http://www.geocities.com/alvesjmp/ 
> ------------------------------------------------- 
> 
> 
> 
> 


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