notícias genômicas

[Luiz Carlos Rozante <rozante@ime.usp.br>]

*** Prossegue a polemica sobre genoma nos EUA

Marcelo Leite escreve para a "Folha de SP":

A semana que passou foi dominada por mais duas noticias relacionadas com a
genomica. 'A primeira vista, foram dois buracos abertos nos trabalhos sobre
o genoma humano publicados com estardalhaco em fevereiro passado.

Abaixo da superficie, porem, os trabalhos divulgados na semana constituem
mais duas batalhas de uma guerra pela primazia sobre o genoma.

A primeira pesquisa saiu quinta-feira na revista britanica "Nature"
(www.nature.com). Foi uma "comunicacao breve", publicada sob o titulo
"Anotacao do genoma da drosofila".

O nome da mosca-das-frutas e da publicacao que deu guarida ao trabalho ja'
serviam de senha para quem acompanha o assunto: la' vinha mais um ataque 'a
empresa Celera, do polemico Craig Venter.

Com efeito, o curto artigo de Samuel Karlin, Aviv Bergman e Andrew Gentles,
da Universidade Stanford, lancava suspeita sobre a competencia da Celera.

Em resumo, questionava que coincidissem com proteinas da mosca 45% das
sequencias de DNA da drosofila identificadas como genes pela empresa, ao
publicar o genoma do inseto.

Gentles disse que nao se tratava de um ataque, mas assim foi entendido pela
Celera, que desqualificou o trabalho como uma simples comunicacao.

Coincidencia ou nao, o troco veio no dia seguinte, sexta. E' o dia da semana
em que circula a revista norte-americana "Science" (www.sciencemag.org),
maior concorrente da "Nature", mas o "paper" foi publicado apenas na
internet, sugerindo que se tratava de algo urgente. O servico on-line se
chama "Sciencexpress".

O alvo dessa vez era o Projeto Genoma Humano (PGH), consorcio publico de
grandes laboratorios dos EUA e do Reino Unido (principalmente) que publicou
uma sequencia do genoma humano em fevereiro, ao mesmo tempo em que a Celera
anunciava a "sua" (o trabalho da PGH havia saido na "Nature" e o de Craig
Venter, na "Science").

Steven Salzberg, Owen White, Jeremy Peterson e Jonathan Eisen, os autores,
militam no Instituto de Pesquisa Genomica (Tigr, na ferina abreviacao em
ingles), nao por acaso dirigido pela mulher de Venter, Claire Fraser.

Como assinalou Nicholas Wade em reportagem do jornal "The New York Times",
eles atacaram a quarta principal descoberta de uma lista de 11 oferecida em
fevereiro pelo PGH em paralelo com sua versao do genoma: a existencia de 223
genes humanos compartilhados com bacterias, que consideram na epoca uma
indicacao forte de que esses microrganismos eram capazes de contrabandear
DNA para dentro do genoma da especie humana, um pesadelo genetico conhecido
como transferencia horizontal.

O pessoal do Tigr refez as comparacoes de sequencias de DNA depositadas em
bancos de dados, incluindo outros organismos, e reduziu a relacao de
supostos genes bacteriumanos a menos de um quarto.

Seu raciocinio e' que, 'a medida que mais genomas de outros organismos forem
concluidos, essa lista encolhera' ate' desaparecer.

Ou seja, nao haveria transferencia horizontal bacteria-homem, mas genes
herdados por vias intricadas dos bons e velhos ancestrais comuns.

Para o publico, e' excelente que os grupos rivais continuem a digladiar-se.
Os rombos que abrem na edificacao do adversario servem para deixar mais
claro que o atual conhecimento sobre o genoma nada tem de uma fortaleza.
(Folha de SP, 21/5)