RE: Estrutura primária do RNA e sua relação com prote

[Luiz Carlos Rozante <rozante@ime.usp.br>]

Olá Rogério! Sobre suas considerações, posso dizer que:

> O que não é claro para mim é se essas duas moléculas r_1 e r_2
> teriam ou não as mesmas estruturas secundárias, terciárias e
> quaternárias. 

a) Se duas seqüências r_1 e r_2 são idênticas elas terão a mesma
   estrutura secunária e terciária;

a) O fato de as seqüências serem diferentes não implica
   necessariamente que as estruturas (secundária e terciária ) sejam
   diferentes; ou seja, se duas moléculas A e B (correspondentes às
   seqüências r_1 e r_2, respectivamente) têm a mesma função -
   provavelmente elas são "parecidas", mas não nada podemos afirmar
   sobre a igualdade entre elas, isto é r_1 e r_2 podem ou não serem
   iguais.
   
   Por exemplo, existe um princípio da biologia molecular que diz que,
   no processo evolucionário, a estrutura é mais conservada do que a
   seqüência de nucleotídeos correspondente; ou seja, como o que
   realmente determina a função de uma molécula é sua estrutura
   (secundária e terciária), supõe-se que na eventualidade de uma
   alteração (devido a fatores mutacionais, por exemplo) em uma
   dada base da seqüência que implique na modificação de sua
   estrutura --- e por conseguinte na sua função --- vai ser
   acompanhada de uma outra alteração de neutralize aquela, de modo
   que a estrutura e função são conservadas. Este tipo de alteração é
   chamada de alteração compensatória.

   Para ilustrar este princípio suponhamos que --- em um dado momento
   evolucionário --- em uma seqüência r_1 a base na posição i é uma
   adenina e forma uma ponte de hidrogênio com a base na posição j (uma
   uracil) e que a ligação entre estas duas bases participa da definição
   da estrutura (secundária e terciária ) da molécula como um
   todo. Agora suponhamos também que --- num outro momento da história
   evolutiva --- a seqüência r_2 deriva de r_1 através da alteração da
   adenina para citosina na posição i. Como r_2 deriva de r_1 é
   razoável pensar que r_2 deva preservar as funções de r_1, afim de
   perpetuar um processo qualquer, a síntese de uma proteína vital por
   exemplo. No entanto, a alteração ocorrida na posição i pode
   comprometer a estrutura da molécula e também sua função, pois a
   citosina na posição i não se ligará com a uracil da posição
   j. Assim mecanismos evolucionários irão garantir que uma outra
   alteração ocorra (no caso a mudança de uracil para guanina na
   posição j) de modo que a ligação entre i e j sejam mantidas e a
   estrura da molécula preservada.


Uma dúvida que tenho é: se as moléculas A e B têm a mesma estrutura
secundária e terciária (entendas-se função), então podemos concluir
que suas seqüências correspondes r_1 e r_2 são diferentes? Ou seja,
será que não existem combinações sobre r_1 e r_2 (para algum par r_1 e
r_2) que levem à mesma estrutura secundária e terciária? Um
palíndrome, por exemplo... Isto tem significado biológico relevante?

Obrigado!!


Luiz Carlos