====== Métodos estatísticos aplicados às Ciências Biológicas (MAE5755) ======
 
 **Julio da Motta Singer** (sala A202)\\
 **Denise Aparecida Botter** (sala A203)\\
 **Horário**: 2a feira das 10:00h às 11:40 e 5a feira das 8:00 às 9:40\\  
 **<fc #FF0000>Link para sala virtual</fc>**: http://meet.google.com/yaa-uxso-dbb (Entrar com e-mail usp; em caso contrário será necessário pedir autorização) \\  
 **Monitor**: Felix Lopes Barboza (felixbarboza@ime.usp.br)\\
 **Atendimento**: 5a feira durante a aula 


  * **Programa**
 ** 1. Introdução **\\

* Estatística descritiva e inferência estatística \\
* Definição e codificação de variáveis \\
* Organização de bancos de dados \\
* Ordem de grandeza, precisão e arredondamento de dados quantitativos \\
* Proporções e porcentagens \\
* Taxas e números índices \\

 **2. Representação gráfica e tabular de distribuições de frequências** \\

* Tabelas de frequências \\
* Gráficos de barras e de pizza \\
* Histogramas \\
* Construção e apresentação de gráficos e tabelas \\

 **3. Medidas resumo** \\

* Medidas de posição (média, mediana, moda e percentis/quartis) \\
* Medidas de dispersão (Variância, desvio padrão, amplitude, intervalo interquartílico) \\
* Gráficos do tipo caixa (“box plots”) \\

 **4. Associação entre variáveis** \\

* Tabelas de contingência \\
* Risco relativo e razão de chances \\
* Sensibilidade e especificidade \\
* Tabelas de médias e desvios padrões \\
* Gráficos de perfis de médias \\
* Gráficos de perfis individuais \\
* Gráficos do tipo QQ \\
* Gráficos de dispersão \\
* Correlação linear \\

 **5. Noções sobre inferência estatística** \\

* Modelos probabilísticos \\
* Estimação pontual \\
* Intervalos de confiança \\
* Testes de hipóteses \\
* Cálculo do tamanho de amostras \\

 **6. Modelos estatísticos e análise inferencial** \\

* Análise de tabelas de contingência \\
* Regressão linear \\
* Análise de variância \\
* Regressão logística \\
* Análise de sobrevivência \\

 **7. Planejamento de estudos experimentais e observacionais** \\

* Determinação do objetivo do estudo \\
* Determinação do tipo de estudo \\
* Detalhamento do estudo \\
* Avaliação da proposta do estudo \\
* Avaliação da generalizabilidade dos resultados \\
* Condução do estudo \\

 **Bibliografia** \\

* Agresti, A. (1995). **Introduction to the analysis of categorical data**. New York: Wiley.\\
* Altman, D.G. (1991). **Practical Statistics for Medical Research**. New York: Chapman and Hall.\\
* Bussab, W.O. e Morettin, P.A. (2014). **Estatística Básica, 8a. edição**. São Paulo: Saraiva.\\ 
* Daniel, W. (1999). **Biostatistics: A foundation for analysis in the Health Sciences, 7th edition**. New York: Wiley.\\
* Fisher, L.D. and Van Belle, G. (1993).  **Biostatistics - A methodology for the health Sciences**. New York: Wiley. \\
* Hosmer, D.W. and Lemeshow, S. (2000). **Applied Logistic Regression, 2nd ed**. New York: Wiley.\\
* Kleinbaum, D.G. (2005). **Logistic regression**, 2nd ed. New York: Springer-Verlag.\\
* Kleinbaum, D.G. and Klein, M. (2005). **Survival analysis: a self-learning text, 2nd ed**. New York: Springer-Verlag.\\
* Kleinbaum, D.G., Kupper, L., Mueller, K.E., and Nazim, A. (1997).**Applied Regression Analysis and Other Multivariable Methods, 3rd.ed**. Boston: Duxbury Press.\\
* Lee, E.T. (1992). **Statistical Methods for Survival data Analysis, 2nd ed** New York: Wiley.\\
* Magalhães, M.N. e Pedroso de Lima, A.C. (2013). **Noções de Probabilidade e Estatística, 7a. edição**. São Paulo: EDUSP.\\
* Marks, R.G. (1982). **Designing a Research Project**. Belmont, CA: Lifetime Learning Publications.\\
* <fc #FF0000>Morettin, P.A. e Singer, J.M. (2020)</fc>: **Estatística e Ciência de Dados**. (Versão parcial preliminar). \\ http://www.ime.usp.br/~jmsinger/MAE0217/cdados2021out12.pdf \\
* Kutner, M.H., Nachtsheim, C.J., Neter, J. and Li, W. (2005). **Applied linear statistical models, 5th ed**. Chicago, Illinois: Irwin.\\ 
* Rosner, B. (1986). **Fundamentals of Biostatistics, 2nd ed**. Mass: PWS Publishers.\\


 **Bibliografia complementar** \\

* Altman, D.G., Gore, S.M., Gardner, M.J. and Pocock, S.J. (1983). Statistical guidelines for contributors to medical journals. **British Medical Journal, 286**, 1489-1493.\\
* Ehrenberg, A.S.C. (1981). The problem of numeracy. **The American Statistician, 35**, 67-71.\\
* Fienberg, S.E. (1979). Graphical methods in Statistics. **The American Statistician, 33**, 165-178.\\ 
* Haynes, R.B., Mulrow, C.D., Huth, E.J., Altman, D.G. and Gardner, M.J. (1990). More informative abstracts revisited. **Annals of Internal Medicine, 113**, 69-76.\\
* Koch, G.G. and Sollecito, W.A. (1984). Statistical considerations in the design, analysis and interpretation of comparative clinical studies. **Drug Information Journal, 18**, 131-151.\\
* Matos, F.G. (1988). O título de um trabalho científico: claro, conciso e criativo. **Ciência e Cultura, 40**, 778-779.\\
* Wainer, H. (1984). How to display data badly. **The American Statistician, 38**, 137-147.\\
* Woodford, F.P. (1967). Sounder thinking through clearer writing. **Science, 156**, 743-745.\\


 **Arquivos de dados** \\

* Braga1998: http://www.ime.usp.br/~jmsinger/Dados/AMWBraga1998.xls \\
* Braga1998mod: http://www.ime.usp.br/~jmsinger/MAE5755/AMWBraga1998.modificado.xls \\
* Espirometria2014: http://www.ime.usp.br/~jmsinger/MAE5755/Espirometria.xls \\
* Espirometria2014R: http://www.ime.usp.br/~jmsinger/MAE5755/Espiro_curso.RData \\
* Colesterol: http://www.ime.usp.br/~jmsinger/MAE5755/Colesterol.RData \\
* Disco: http://www.ime.usp.br/~jmsinger/MAE5755/disco.xls

 **Material auxiliar** \\

* Sugestões para construção de gráficos e tabelas: http://www.ime.usp.br/~jmsinger/Textos/Tabelasegraficos.doc \\
* Link para tutorial R: https://didatica.tech/curso-de-r-online-para-iniciantes/ \\
* Função R para cálculo de medidas de associação em tabelas 2x2 (elaborada por Gustavo A. Ballen): https://gist.github.com/gaballench/da91607fe5f80de5a619 \\
* Resumo: http://www.ime.usp.br/~jmsinger/MAE5755/GastroHepato2016.pdf

 **Listas de exercícios**:  \\

  - Lista 1: Exercícios 2, 4, 5, 6 e 8 do Capítulo 2 de Morettin e Singer (2020ago24). Entrega (arquivo pdf) em 10/09/2020. 
  - Lista 2: Exercícios 2, 6, 12, 15, 16, 18, 21, 25, 28, 29, e 32 (opcional) do Capítulo 3 de Morettin e Singer (2020set13), justificando as respostas para os exercícios apresentados na forma de testes. \\ Entrega (arquivo pdf) em 28/09/2020.
  - Lista 3: Exercícios 1, 5, 10, 14, 15, 16, 19, 21 e 23 do Capítulo 4 de Morettin e Singer (2020set30), justificando as respostas para os exercícios apresentados na forma de testes. \\ Entrega (arquivo pdf) em 15/10/2020.
  - Lista 4:
  - Lista 5:
  - Lista 6


 **<fc #FF0000>Observação</fc>**: As listas devem ser necessariamente entregues em grupo. Os grupos estão definidos na planilha disponível em: \\ http://www.ime.usp.br/~jmsinger/MAE5755/Grupos.xlsx.