Deyvid Amgarten

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Nela você vai encontrar informações sobre mim e sobre a pesquisa que faço.
Sobre mim

  • Contato: No que eu puder ajudar, só mandar um email para: deyvid.amgarten [arroba] usp.br
  • Acabei de receber o meu título de mestre pelo programa de pós-graduação interunidades em bioinformática da Universidade de São Paulo, do qual fui representante discente.
  • Fui bolsista FAPESP durante o mestrado.
  • A dissertação desenvolvida pelo Laboratório de Bioinformática USP (LBI) envolveu a análise computacional da diversidade de vírus em amostras metagenômicas, metatranscritômicas e isolados de fagos do processo de compostagem.
  • Como parte da minha dissertação de mestrado, fiz um estágio de pesquisa no exterior no Viral Bioinformatics Resource Center (VBRC), em Victoria - Canadá. O estágio foi financiado por uma bolsa BEPE-FAPESP.
  • Ajudo na organização do Curso de Verão em Bioinformática USP que tem por objetivo divulgar a bioinformática para futuros ingressantes na pós-graduação.
  • Dupla titulação (bacharelado e licenciatura) em Ciências Biológicas pelo Instituto de Biociências da Universidade de São Paulo (IB-USP). Durante a graduação desenvolveu Projeto de Iniciação Científica na área de bioinformática cujo o objetivo principal foi criar um Componente de anotação automática de vias metábolicas (KEGG) para a plataforma EGene de anotação automática de sequências.
  • Experiência em caracterização computacional de sequências, desenvolvimento de ferramentas bioinformáticas, genômica comparativa, metagenômica e virologia. Bom conhecimento em linguagem de programação C, Perl e JAVA básico.
O que são vírus?

São pequenos agentes infecciosos capazes de desenvolver metabolismo e replicação somente dentro de células vivas.


  • Atualmente acreditamos que vírus são as entidades biológicas mais abundantes da biosfera.
  • Vírus infectam virtualmente todo tipo de célula e organismo.
  • Muitos pesquisadores acreditam que esses pequenos organismos podem ser responsáveis por processos complexos e muito mais importantes do que imaginávamos
  • Vírus permite que uma planta cresça em rochas a altas temperaturas (link)
  • Vírus pode ser responsável por transformar joaninhas em zumbis e força-las a cuidar de um casulo de vespas (link)
  • Fagos como uma alternativa a antibióticos para matar bactérias que causam infecção (link)

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Bioinformática

Área multidiciplina de estudo e pesquisa responsável pela aplicação de técnicas computacionais para a resolução de problemas biológicos.

Conheça mais




Publicações

Vírus e bioinformática (inglês)

Seminário em vídeo falando sobre a aplicação de técnicas de bioinformática e metagenômica no estudo de vírus

Novos fagos de Pseudomonas isolados da Compostagem

Artigo publicado como resultado da dissertação de mestrado reportando novos fagos de Pseudomonas e sua possível aplicação no combate a infecções resistentes a antibióticos

Aliados improváveis

Reportagem de capa da edição de Julho 2017 falando sobre a possível aplicação de fagos no combate a infecções resistentes a antibióticos
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