Theses and Dissertations - Instituto de Matemática e Estatística

Date	Level	Title	Student	Advisor
19/08/2020	Master	Análise e reconhecimento da forma tripomastigota de Trypanosoma cruzi para parasitemia automatizada em imagens com baixa densidade de pontos	Diogo Matos da Silva	Helder Takashi Imoto Nakaya
29/05/2020	Doctorate	Analise integrada de alterações somáticas e transcricionais em tumores de pâncreas	Diogo Vieira da Silva Pellegrina	Eduardo Moraes Rego Reis
31/03/2020	Master	Detecção de populações em dados de sequenciamento de RNA de células individuais por meio de módulos de coexpressão	Tiago Lubiana Alves	Helder Takashi Imoto Nakaya
23/03/2020	Master	Identificação e anotação de RNAs longos não-codificantes em Schistosoma mansoni e Schistosoma japonicum	Lucas Ferreira Maciel	Sergio Verjovski de Almeida
30/10/2019	Doctorate	Regulação pós-transcricional em Halobacterium salinarum NRC-1: caracterização do gene VNG_RS05855	Junier Marrero Gutierrez	Tie Koide
25/10/2019	Doctorate	GTACG: Um arcabouço computacional focado em genômica comparativa de bactérias de um mesmo ramo evolutivo	Caio Rafael do Nascimento Santiago	Luciano Antonio Digiampietri
21/10/2019	Master	Genômica comparativa aplicada no estudo da invasividade de Streptococcus pyogenes	Suzane de Andrade Barboza	Luciano Antonio Digiampietri
27/09/2019	Master	Genômica comparativa e filogenômica de Xylella fastidiosa	Guillermo Uceda Campos	Aline Maria da Silva
04/09/2019	Master	Análise comparativa do genoma de bacteriófagos isolados da compostagem e estudo dos determinantes de sua interação com Pseudomonas aeruginosa	Fernando Pacheco Nobre Rossi	Aline Maria da Silva
22/08/2019	Master	Análise Estrutural de Sítios de Fosforilação em Proteína	Juan Enrique Faya Castillo	Paulo Sérgio Lopes de Oliveira
20/08/2019	Doctorate	Classificação Taxonômica de Sequências obtidas com Meta-ômicas por meio de Integração de Dados	Felipe Prata Lima	João Carlos Setubal
09/08/2019	Master	Herdabilidade e Estudo de Associação Genômica Ampla (GWAS) de Atividade Física Autorreportada - uma investigação de famílias brasileiras	Jean Michel Rocha Sampaio Leite	Julia Maria Pavan Soler
05/08/2019	Master	Análise transcritômica de amostras humanas naturalmente infectadas por Chikungunya Virus	Natália Baptista Cruz	Helder Takashi Imoto Nakaya
02/08/2019	Doctorate	Uma abordagem integrada para a construção e utilização de HMMs de perfil para análises genômicas e metagenômicas	Liliane Santana Oliveira Kashiwabara	Arthur Gruber
12/07/2019	Master	Análise transcritômica de macacos Rhesus durante infecção por Zika Vírus	Mariana Araújo Pereira	Helder Takashi Imoto Nakaya
10/07/2019	Doctorate	Rastreando arbovírus em ambientes silvestre e urbano	Marielton dos Passos Cunha	Paolo Marinho de Andrade Zanotto
02/07/2019	Doctorate	Mineração de dados de anemia falciforme e priapismo	Mina Cintho Ozahata	João Eduardo Ferreira
04/06/2019	Master	Papel do colágeno na síndrome congênita de Zika: uma abordagem de Biologia de Sistemas	Fábio Baldívia Pohl	Helder Takashi Imoto Nakaya
09/05/2019	Doctorate	Desenvolvimento de uma Ferramenta Computacional para Análise de Co-Expressão Gênica e sua Aplicação na Biologia de Sistemas	Pedro de Sá Tavares Russo	Helder Takashi Imoto Nakaya
08/05/2019	Master	Análise da Tetramerização da Proteína CD38 por meio de Docking Molecular	Jadson Carlos dos Santos	Silvana Giuliatti
27/03/2019	Doctorate	Ordenação evolutiva de genes	Pedro Ivo Gomes de Faria	João Carlos Setubal
27/02/2019	Doctorate	Identificação e anotação funcional de novos transcritos com expressão alterada no câncer pancreático	Omar Julio Sosa	Eduardo Moraes Rego Reis
22/02/2019	Master	Construção e Aplicação de HMMs de Perfil para a Detecção e Classificação de Vírus	Miriã Nunes Guimarães	Arthur Gruber
07/02/2019	Doctorate	Predição de função para TSSaRNAs (transcritos associados a sitios de início de transcrição) em Halobacterium salinarum NRC-1	Yagoub Ali Ibrahim Adam	Ricardo Zorzetto Nicoliello Vencio
13/12/2018	Master	Usando Biologia de Sistemas para entender a Imunossenescência	Fernando Marcon Passos	Helder Takashi Imoto Nakaya
12/12/2018	Doctorate	Investigação de perfis microbianos humanos e sua relação com o câncer	Andrew Maltez Thomas	João Carlos Setubal
10/12/2018	Doctorate	Incorporação de evidências biológicas para a identificação de SNPs interferindo em sítios alvos de miRNAs	Paula Prieto Oliveira	Ariane Machado Lima
26/09/2018	Doctorate	Transcriptoma, Sítios de Ligação para Fatores de Transcrição e Região Promotora de cana-de-açúcar	Mauro de Medeiros Oliveira	Glaucia Mendes Souza
08/05/2018	Master	Halobacterium salinarum NRC-1: Rede de Regulação Gênica e sua análise probabilística	Guilherme Martins Crocetti	Ricardo Zorzetto Nicoliello Vencio
03/05/2018	Master	Genômica comparativa de tripanossomatídeos portadores de endossimbiontes e sua implicação no genoma de Angomonas ambiguus	Anderson Carvalho Morais	João Marcelo Pereira Alves
10/04/2018	Doctorate	Genômica Comparada e a Evolução da Defesa Química em Anfíbios	Denis Jacob Machado	Taran Grant
23/03/2018	Master	Métodos de validação tradicional e temporal aplicados à avaliação de classificadores de RNAs codificantes e não codificantes	Clebiano da Costa Sá	Ariane Machado Lima
15/03/2018	Doctorate	Redes Neurais Residuais Profundas e Autômatos Celulares como Modelos para Predição que Fornecem Informação Sobre a Formação de Estruturas Secundárias Proteicas.	José Geraldo de Carvalho Pereira	Paulo Sérgio Lopes de Oliveira
08/02/2018	Master	BioNetStat: Uma ferramenta para análise diferencial de redes biológicas	Vinícius Jardim Carvalho	Marcos Silveira Buckeridge
06/02/2018	Master	Detecção de Copy Number Variation (CNV) e sua caracterização na população brasileira	Ana Cláudia Martins Ciconelle	Julia Maria Pavan Soler
14/12/2017	Doctorate	Systems Integration Tool: uma ferramenta para integração e visualização de dados em larga escala e sua aplicação em cana-de-açúcar	Amanda Rusiska Piovezani	Marcos Silveira Buckeridge
27/11/2017	Master	Análise Transcricional de RNAs Não Codificadores Longos em Pacientes com Dengue	Matheus Carvalho Bürger	Helder Takashi Imoto Nakaya
24/11/2017	Master	Análise do transcritoma de Haemophilus influenzae tipo b durante o processo de fermentação em biorreator	Carlos Eduardo Madureira Trufen	Anatoli Iambartsev
24/11/2017	Master	Determinação pré-natal não invasiva de paternidade utilizando micro-haplótipos	Jaqueline Yu Ting Wang	Helder Takashi Imoto Nakaya
22/11/2017	Doctorate	Arquitetura genética dos genes codificadores de proteínas ligantes de RNA	Fernando Cipriano de Andrade Oliveira	André Fujita
30/10/2017	Master	Análise do transcritoma do mexilhão marrom (Perna perna) sob contaminação por antraceno	Jhonatas Sirino Monteiro	João Carlos Setubal
27/10/2017	Master	Predição Computacional de Sítios de Ligação de Fatores de Transcrição Baseada em Gramáticas Regulares Estocásticas.	Antonio Ferrão Neto	Ariane Machado Lima
20/10/2017	Master	Modelagem e implementação de banco de dados clínicos e moleculares de pacientes com câncer e seu uso para identificação de marcadores em câncer de pâncreas	Ester Risério Matos Bertoldi	Eduardo Moraes Rego Reis
09/10/2017	Doctorate	Estruturas de Redes em Ossos ao longo do desenvolvimento	Cynthia Martins Villar Couto	Luciano da Fontoura Costa
10/08/2017	Doctorate	O papel de Transferência Horizontal de Genes na história evolutiva de duas classes de genes em bactérias	Luiz Thibério Lira Diniz Rangel	João Carlos Setubal
09/08/2017	Master	"Uso de técnicas de reconhecimento de padrões e genetica para a predição de transtornos psiquiatricos da infância"	Walkiria Karla Resende	Helena Paula Brentani
08/08/2017	Doctorate	Identificação e análise in silico de ncRNAs empregando dados de RNA-seq em Leishmania.	Patrícia de Cássia Ruy	Angela Kaysel Cruz
04/08/2017	Master	Alinhamento Múltiplo de Genomas de Eucariotos com Montagens Altamente Fragmentadas	George Willian Condomitti Epamino	João Carlos Setubal
12/06/2017	Master	Caravela: um navegador para metagenomas	Gianluca Major Machado da Silva	João Carlos Setubal
02/06/2017	Doctorate	O transcritoma da retinopatia induzida por oxigênio e uma assinatura gênica prognóstica baseada em angiogênese para predição de recidiva de cancer de mama	Rodrigo Guarischi Mattos Amaral de Sousa	João Carlos Setubal
17/04/2017	Doctorate	Um modelo Bayesiano de Meta-Análise para dados de Chip-Seq	Pablo de Morais Andrade	Carlos Alberto de Braganca Pereira
11/04/2017	Doctorate	LincRNAs fisicamente associados ao receptor de andrógeno modificam o perfil de marcas da cromatina vizinha e alteram a expressão gênica local	Lucas Ferreira da Silva	Sergio Verjovski de Almeida
10/04/2017	Master	COARSE-GRAINED MODELING OF THE PROTEIN COMPLEXATION PHENOMENA	Sergio Alejandro Poveda Cuevas	Fernando Luis Barroso da Silva
21/02/2017	Master	Análise de transcritomas de células de pacientes xeroderma pigmentosum após irradiação com luz UVA e estudo de retrocópias de genes de reparo	Francisco Ivanio Arruda Alves	Carlos Frederico Martins Menck
15/02/2017	Doctorate	A transcrição pervasiva na archaea Halobacterium salinarum NRC-1 e a identificação de novos transcritos	Felipe ten Caten	Tie Koide
24/01/2017	Master	Estudo por simulação computacional em larga escala da complexação de proteínas do leite	Lariani Aparecida Delboni	Fernando Luis Barroso da Silva
21/12/2016	Master	Análise exploratória de genes compostos predominantemente por microexons arranjados em tandem em uma coleção de anotações de genomas	Bruno Ferreira de Souza	Sergio Verjovski de Almeida
09/12/2016	Doctorate	Análise computacional dos genomas de duas estirpes brasileiras de Bradyrhizobium de importância econômica	Gesiele Almeida Barros de Carvalho	Marie Anne van Sluys
18/11/2016	Master	Análise computacional da diversidade viral presente na comunidade microbiana do processo de compostagem do Zoológico de São Paulo	Deyvid Emanuel Amgarten	João Carlos Setubal
17/11/2016	Master	Análise do Metaboloma da Cana-de-Açúcar ao Longo do Ciclo de Maturação da Planta	Davi Toshio Inada	Glaucia Mendes Souza
13/10/2016	Master	Estudo comparativo de duas estratégias utilizadas na busca de relações funcionais entre genes	Juan Manuel Vidal Garcia	André Fujita
06/10/2016	Doctorate	Origem de genes recentes, uma abordagem com PSSMs deterioradas e arquiteturas de domínio proteico	Diego Trindade de Souza	Sergio Russo Matioli
12/08/2016	Doctorate	Suporte ao desenvolvimento e à composição de serviços web semânticos para a análise de expressão gênica	Gabriela Der Agopian Guardia	Clever Ricardo Guareis de Farias
08/08/2016	Master	Uma Arquitetura de Question-Answering Instanciada no Domínio de Doenças Crônicas	Luciana Farina Almansa	Alessandra Alaniz Macedo
28/07/2016	Master	Análise global da expressão de RNAs não codificadores no sistema imunológico humano na senescência e sepse	Diogo Vieira da Silva Pellegrina	Eduardo Moraes Rego Reis
15/07/2016	Doctorate	Bioinformática aplicada à biologia sistêmica para a identificação dos fatores regulatórios do acúmulo de sacarose no colmo da cana-de-açúcar	Fabrício Edgar de Moraes	Carlos Alberto Labate
25/05/2016	Master	Desenvolvimento de um pipeline para anáise genômica de metilação do DNA	Henrique Cursino Vieira	Helena Paula Brentani
02/05/2016	Doctorate	Integração de dados na inferência de redes de genes: avaliação de informações biológicas e características topológicas	Fábio Fernandes da Rocha Vicente	Fabricio Martins Lopes
25/04/2016	Doctorate	Identificação in silico de ncRNAs no organismo modelo Halobacterium salinarum NRC-1	Marcos Abraão de Souza Fonseca	Ricardo Zorzetto Nicoliello Vencio
25/04/2016	Master	Caracterização de sítios conformacionais de fosforilação em proteínas	Felipe Augusto Nunes Ferraz	Paulo Sérgio Lopes de Oliveira
20/04/2016	Doctorate	Caracterização e modelagem da atividade eletrofisiológica em pacientes com epilepsia	Abner Cardoso Rodrigues Neto	Koichi Sameshima
15/04/2016	Master	Reconstrução da rede metabólica em escala genômica da bactéria Burkholderia sacchari	Paulo Moisés Raduan Alexandrino	André Fujita
29/03/2016	Doctorate	Desenvolvimento de um modelo biofísico para a descrição do processo de reparo de quebra-dupla em DNA	Aymara Martínez Aragón	Joao Dias de Toledo Arruda Neto
18/03/2016	Master	Processamento, extração de características e análise morfométrica automatizada de fibras mielínicas	Rômulo Bourget Novas	Joaquim Cezar Felipe
11/12/2015	Master	Ferramenta computacional para análise integrada de dados clínicos e biomoleculares	Yuri Ferretti	Joaquim Cezar Felipe
03/12/2015	Master	Implementação de abordagens computacionais para identificação de RNAs longos não codificadores envolvidos na diferenciação neural	Gabriel Francisco Zaniboni	Eduardo Moraes Rego Reis
30/11/2015	Doctorate	Algoritmos evolutivos aplicados na investigação da adaptabilidade do código genético	Lariza Laura de Oliveira	Renato Tinós
17/11/2015	Doctorate	Implementação de uma abordagem híbrida utilizando modelagem comparativa e ab initio para predição de estruturas tridimensionais de proteínas contendo múltiplos domínios com conectores flexíveis	Rodrigo Vargas Honorato	Paulo Sérgio Lopes de Oliveira
13/10/2015	Doctorate	Análise de componentes esparsos locais com aplicações em ressonância magnética funcional	Gilson Vieira	Luíz Antonio Baccala
08/10/2015	Master	Busca de variantes em sequência de DNA proveniente de pacientes com deficiência em processos de reparo do genoma	Livia Maria Silva Moura	Carlos Frederico Martins Menck
06/10/2015	Master	Caracterização da estrutura e dinâmica das redes funcionais neurais durante um processo de indução anestésica	Eduardo Cocca Padovani	André Fujita
23/09/2015	Master	Reconstrução e análise de genomas de bactérias de compostagem a partir de dados metagenômicos	Leandro Nascimento Lemos	João Carlos Setubal
21/09/2015	Master	Suporte ao desenvolvimento e à integração de ontologias no domínio biomédico	Ricardo Cacheta Waldemarin	Clever Ricardo Guareis de Farias
02/09/2015	Master	Exploração de espaços de parâmetros de modelos biológicos sob diferentes paradigmas estatisticos	Andre Chalom Machado de Oliveira	Paulo Inácio de Knegt López de Prado
21/08/2015	Doctorate	Análise computacional da variação do potencial metabólico microbiano em metagenomas	Deibs Barbosa	João Carlos Setubal
17/08/2015	Master	Modelagem computacional de famílias de proteínas microbianas relevantes para produção de bioenergia	Fernanda Orpinelli Ramos do Rego	João Carlos Setubal
22/07/2015	Doctorate	Uma abordagem integrativa usando dados de interação proteína-proteína e estudos genéticos para priorizar genes e funções biológicas em transtorno de déficit de atenção e hiperatividade	Leandro de Araujo Lima	Helena Paula Brentani
30/06/2015	Doctorate	Uma abordagem de integração de dados de redes PPI e expressão gência para priorizar genes relacionados a doenças complexas	Sérgio Nery Simões	Ronaldo Fumio Hashimoto
13/04/2015	Doctorate	Desenvolvimento da plataforma CaneRegNet para anotação funcional e análises do transcriptoma da cana-de-açúcar	Milton Yutaka Nishiyama Junior	Glaucia Mendes Souza
04/02/2015	Master	Utilização de informações termodinâmicas e estruturais na predição de sítios de ligação de receptores nucleares ao DNA: uma abordagem computacional	Ana Claudia Mancusi Valeije	Paulo Sérgio Lopes de Oliveira
05/12/2014	Doctorate	Caracterização de processos evolutivos de vírus de RNA a partir de padrões deixados nas filogenias virais	Caio César de Melo Freire	Paolo Marinho de Andrade Zanotto
01/12/2014	Master	Análise gênica de comorbidades a partir da integração de dados epidemiológicos	Karla Ferraz Néto	Evandro Eduardo Seron Ruiz
19/08/2014	Master	Infraestrutura computacional para avaliação de similaridade funcional composta entre microRNAs baseada em ontologias	Mariana Yuri Sasazaki	Joaquim Cezar Felipe
15/05/2014	Master	Framework para classificação das mutações de vírus HIV	Mina Cintho Ozahata	João Eduardo Ferreira
14/04/2014	Doctorate	Metodologia para integração de dados genômicos, transcriptômicos e epigenéticos de câncer de pênis	Fabio Albuquerque Marchi	Silvia Regina Rogatto
12/12/2013	Doctorate	Explorando a complexidade do transcriptoma humano	José Eduardo Kroll	Sandro José de Souza
07/11/2013	Doctorate	Troost - Busca de interações entre trios de SNPs em estudos de associação de genoma inteiro	José Osório de Oliveira Azevedo Neto	Sergio Russo Matioli
25/10/2013	Master	Sifter-T: Um framework escalável para anotação filogenômica probabilística funcional de domínios protéicos	Danillo Cunha de Almeida e Silva	Ricardo Zorzetto Nicoliello Vencio
17/10/2013	Master	Busca guiada de patentes de Bioinformática	Marcio Branquinho Dutra	Alessandra Alaniz Macedo
24/09/2013	Master	Um filtro iterativo utilizando árvores de decisão	Oscar Picchi Netto	José Augusto Baranauskas
12/09/2013	Master	SIMTar: uma ferramenta para predição de SNPs interferindo em sítios alvos de microRNAs	Amanda Rusiska Piovezani	Ariane Machado Lima
30/08/2013	Master	Uma adaptação do método Binary Relevance utilizando árvores de decisão para problemas de classificação multirrótulo aplicado à genômica funcional	Erica Akemi Tanaka	José Augusto Baranauskas
27/08/2013	Master	Uma abordagem para a construção de uma única árvore a partir de uma Random Forest para classificação de bases de expressão gênica	Thais Mayumi Oshiro	José Augusto Baranauskas
13/08/2013	Doctorate	Caracterização in silico e análise de expressão de RNAs não codificadores longos no genoma de eucariotos	Vinicius Ramos Henriques Maracajá Coutinho	Sergio Verjovski de Almeida
24/06/2013	Master	Análise in silico de regiões promotoras de genes de Xylella fastidiosa	Fernando Domingues Kümmel Tria	Aline Maria da Silva
17/06/2013	Master	Método de apoio à pesquisa e ao diagnóstico clínico na identificação de acometimento em diferentes tipos de fibras musculares por meio de imagens histopatológicas	Marlon Polo de Melo	Joaquim Cezar Felipe
06/02/2013	Master	Genômica translacional: integrando dados clínicos e biomoleculares	Newton Shydeo Brandão Miyoshi	Joaquim Cezar Felipe
25/10/2012	Doctorate	Estudo da poliadenilação alternativa: efeito dos polimorfismos nos elementos em cis no RNA e de transcritos em antissenso	Suzana Andreoli Marques Ezquina	Sandro José de Souza
17/10/2012	Master	Dinâmica da fermentação alcóolica: aplicação de redes booleanas na dinâmica de expressão gênica em linhagens de Saccharomyces Cerevisiae durante o processo fermentativo	Melline Fontes Noronha	Ronaldo Fumio Hashimoto
05/10/2012	Master	Inovações em técnicas de alinhamentos múltiplos e predições de genes	Vitor Ferreira Onuchic	Alan Mitchell Durham
28/09/2012	Master	Função de avaliação dinâmica em algoritmos genéticos aplicados na predição de estruturas tridimensionais de proteínas	Luís Henrique Uchida Ishivatari	Renato Tinós
17/07/2012	Master	Auto-organização da população em sistemas imunológicos artificiais aplicada ao docking de proteínas	Helder Ken Shimo	Renato Tinós
29/05/2012	Master	Método para auxiliar a interpretação de clusters de expressão gênica considerando sumarização automática	Daniane Silva de Paula	Alessandra Alaniz Macedo
23/05/2012	Doctorate	Descrição da proveniência de dados para extração de conhecimento em sistemas de informação de hemoterapia	Fernanda Nascimento Almeida	Ester Cerdeira Sabino
18/04/2012	Master	Uma abordagem para a indução de árvores de decisão voltada para dados de expressão gênica	Pedro Santoro Perez	José Augusto Baranauskas
13/04/2012	Doctorate	Bioinformática aplicada em RNomics: estratégias computacionais para caracterização de RNAs não-codificadores	Alexandre Rossi Paschoal	Alan Mitchell Durham
13/04/2012	Master	Uso de mapeamento conceitual para redução da descontinuidade semântica na recuperação de imagens microscópicas de carcinoma tireoidiano	Hugo César Pessotti	Alessandra Alaniz Macedo
02/04/2012	Master	Análise computacional do genoma e transcritoma de Plasmodium vivax: contribuições da bioinformática para o estudo da malária	Bruna Renata Silva Corrêa	Ricardo Zorzetto Nicoliello Vencio
06/03/2012	Master	Representação paramétrica de famílias de redes booleanas que produzem ondas de propagação	Ubiratan Augusto Lima	Junior Barrera
15/12/2011	Master	Uma abordagem baseada em ontologias e conectores para a integração semântica de ferramentas de análise de expressão gênica	Flavia Akemi Miyazaki	Clever Ricardo Guareis de Farias
28/11/2011	Master	Auxílio na prevenção de doenças crônicas por meio de mapeamento e relacionamento conceitual de informações em biomedicina	Juliana Tarossi Pollettini	Alessandra Alaniz Macedo
24/11/2011	Master	Método para processamento e análise computacional de imagens histopatológicas visando apoiar o diagnóstico de câncer de colo de útero	Gisele Helena Barboni Miranda	Joaquim Cezar Felipe
08/07/2011	Master	Modelagem matemática-computacional da conectividade cerebral em ressonância magnética funcional para o estudo do estado de repouso	Gilson Vieira	Luíz Antonio Baccala
25/05/2011	Master	Desenvolvimento de um algoritmo para identificação e caracterização de cavidades em regiões específicas de estruturas tridimensionais de proteínas	Saulo Henrique Pires de Oliveira	Paulo Sérgio Lopes de Oliveira
20/05/2011	Master	Uso de estratégias baseadas em conhecimento para algoritmos genéticos aplicados à predição de estruturas tridimensionais de proteínas	Lariza Laura de Oliveira	Renato Tinós
20/04/2011	Master	Canalização: fenótipos robustos como consequência de características da rede de regulação gênica	Vitor Hugo Louzada Patricio	Ronaldo Fumio Hashimoto
21/02/2011	Doctorate	Redes complexas de expressão gênica: síntese, identificação, análise e aplicações	Fabricio Martins Lopes	Roberto Marcondes Cesar Junior
03/11/2010	Doctorate	Seleção natural no vírus da hepatite C: influência do sistema imune na resposta ao tratamento	Artur Trancoso Lopo de Queiroz	Sergio Russo Matioli
29/07/2010	Master	Medidas de dependência entre séries temporais: estudo comparativo, análise estatística e aplicações em neurociências	Carlos Stein Naves de Brito	Koichi Sameshima
16/04/2010	Doctorate	Aplicação de métodos estatísticos e computacionais para o estudo da cis-regulação da expressão gênica	Marcio Augusto Afonso de Almeida	Paulo Sérgio Lopes de Oliveira
11/02/2010	Doctorate	Identificação de transferência gênica horizontal em procariotos, estudo do regulon SOS de Caulobacter crescentus e análise estatística de colocalização de posições genômicas	Apuã César de Miranda Paquola	Carlos Frederico Martins Menck
01/12/2009	Doctorate	Abordagem algébrica para seleção de clones ótimos em projetos genomas e metagenomas	Mauricio Egidio Cantão	Eliana Gertrudes Macedo Lemos
12/05/2009	Doctorate	Planejamento, gerenciamento e análise de dados de microarranjos de DNA para identificação de biomarcadores de diagnóstico e prognóstico de cânceres humanos	Ana Carolina Quirino Simões	Aline Maria da Silva
06/05/2009	Doctorate	Técnicas para análise do crescimento e movimento das células neurais	Leandro Carrijo Cintra	Luciano da Fontoura Costa
15/01/2009	Doctorate	Medidas de fluxo de informação com aplicação em neurociência	Daniel Yasumasa Takahashi	Koichi Sameshima
11/12/2008	Doctorate	Análise da via de regulação gênica por ácido retinóico: uma abordagem por bioinformática e biologia estrutural	Tiago José Paschoal Sobreira	Paulo Sérgio Lopes de Oliveira
02/12/2008	Doctorate	Identificação in-silico de genes humanos submetidos à expressão alélica diferencial	Jorge Estefano Santana de Souza	Sandro José de Souza
25/09/2008	Doctorate	Morfometria computacional de frangos de corte submetidos a duas dietas distintas: suplementação mineral quelada versus suplementação mineral tradicional	Rafael Carvalho de Oliveira	Marcelo Emílio Beletti
03/09/2008	Doctorate	Métodos estatísticos para a análise de bibliotecas digitais de expressão gênica	Leonardo Varuzza	Carlos Alberto de Braganca Pereira
13/05/2008	Doctorate	Sistema colaborativo para armazenamento e análise de dados de HIV	Luciano Vieira de Araújo	João Eduardo Ferreira
25/04/2008	Doctorate	Modelos discretos para sistemas de sinalização celular baseados no contato célula-célula	Luiz Carlos da Silva Rozante	Marco Dimas Gubitoso
14/04/2008	Doctorate	Representação de sistemas biológicos a partir de sistemas dinâmicos: controle da transcrição a partir do estrógeno	Marcelo Ris	Junior Barrera
14/02/2008	Doctorate	Análise computacional da expressão gênica no parasita protostomado Schistosoma mansoni.	Thiago Motta Venancio	Sergio Verjovski de Almeida
20/12/2007	Doctorate	Métodos computacionais para a caracterização e análise da relação entre anatomia e expressão gênica em sistemas biológicos.	Bruno Augusto Nassif Travençolo	Luciano da Fontoura Costa
10/12/2007	Doctorate	Bioinformática estrutural de proteínas modificadas por eventos de splicing alternativo	Elza Helena Andrade Barbosa Durham	Sandro José de Souza
03/10/2007	Doctorate	"Seleção de modelos através de um teste de hipótese genuinamente Bayesiano: misturas de normais multivariadas e hipóteses separadas"	Marcelo de Souza Lauretto	Julio Michael Stern
10/08/2007	Doctorate	"Análise de dados de expressão gênica: normalização de microarrays e modelagem de redes regulatórias"	André Fujita	Carlos Eduardo Ferreira
27/06/2007	Doctorate	Modelagem do controle gênico do ciclo celular por redes genéticas probabilísticas	Nestor Walter Trepode	Junior Barrera
30/05/2007	Doctorate	"Fatores moleculares da determinação do sexo e casta e evolução de famílias multigênicas na abelha eusocial Apis mellifera"	Alexandre dos Santos Cristino	Zila Luz Paulino Simoes
16/05/2007	Doctorate	Implicações funcionais de eventos de splicing alternativo no proteoma humano	Fabio Passetti	Paulo Sérgio Lopes de Oliveira
23/03/2007	Doctorate	Métodos estatísticos para a análise de dados de cDNA microarray em um ambiente computacional integrado	Gustavo Henrique Esteves	Eduardo Jordao Neves
19/01/2007	Doctorate	Cadeias estocásticas parcimoniosas com aplicações à classificação e filogenia das seqüências de proteínas	Florencia Graciela Leonardi	Jefferson Antonio Galves
16/01/2007	Doctorate	Análise e reconhecimento digital de formas biológicas para o diagnóstico automático de parasitas do gênero Eimeria	Cesar Armando Beltran Castañon	Arthur Gruber
20/12/2006	Doctorate	Predição de RNAs não codificantes e sua aplicação na busca do componente RNA da telomerase	Ariane Machado Lima	Alan Mitchell Durham
09/11/2006	Doctorate	Um novo modelo para cálculo de probabilidade de paternidade - concepção e implementação	Fábio Nakano	Carlos Alberto de Braganca Pereira
01/09/2006	Doctorate	Análise estatística na interpretação de imagens: microarranjos de DNA e ressonância magnética funcional	Ricardo Zorzetto Nicoliello Vencio	Carlos Alberto de Braganca Pereira

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