Combinatorics Research Group
Posdocs, Ph.D. and MSc. Students
Posdocs
  -  Julia Boettcher, PhD, Technische Universität München, Germany 
      Project's title: Problemas de imersão e empacotamento em teoria
     extremal dos grafos 
      Supervisor: Prof. Y. Kohayakawa 
      Post-doc since October 2009 (Bolsa da Comunidade Europeia e FAPESP). 
 
Ph.D. Students
  -  Alexandre Silva Freire, MSc., USP 
      
 Advisor: Prof. C.E. Ferreira
      
 Project's title: Cobertura de grafos por bicliques
      
 Bolsa da CAPES.
      
   -  Álvaro Junio Pereira Franco, MSc., USP
      
 Advisor: Prof. C.E. Ferreira
      
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 Bolsa da CAPES.
   -  Daniel Aparecido Geraldini
      
 Advisor: Prof. Y. Kohayakawa 
      
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 Bolsa do CNPq.
	  
   -  Francisco Elói Soares de Araujo, MSc., USP 
      
 Advisor: Prof. J.A. Soares
      
 Project's title: Alinhamento de várias seqüências
   -  Guilherme Oliveira Mota, MSc., UFC
      
 Advisor: Prof. Y. Kohayakawa 
      
 Project's title: Combinatória assintótica de estruturas esparsas e regularidade
      
 Bolsa da FAPESP.
      
   -  Karla Roberta Pereira do
      Nascimento, MSc., UFG
      
 Advisor: Prof. Y. Wakabayashi
      
 Project's title: Recoloração convexa de árvores filogenéticas
      
 Bolsa do CNPq. 
      
   -  Mário Leston Rey, MSc., USP
      
 Advisor: Prof. Y. Wakabayashi 
      
 Project's title: Partição das arestas de um grafo em um número mínimo de caminhos 
   -  Márcio Takashi Iura Oshiro , MSc., USP
      
 Advisor: Prof. C.G. Fernandes
      
 Project's title: Problemas de escalonamento
      
 Bolsa da CAPES.
      
   -  Rafael Crivellari Saliba Schouery
      
 Advisor: Prof. C.G. Fernandes
      
 Project's title: Teoria dos jogos algorítmica
      
 Bolsa da FAPESP.
 
MSc. Students
      
  -  Alex Andre da Costa Soares
      
 Advisor: Prof. C.G. Fernandes
      
 Project's title: Árvores geradoras com número máximo de folhas
   -  Alexandre Luiz Junqueira Hadura Albano
      
 Advisor: Prof. A.P. do Lago
      
 Project's title: Reticulados de conceitos
      
 Bolsa do CNPq.
      
   -  Ander Conselvan de Oliveira
      
 Advisor: Prof. C.E. Ferreira
      
 Project's title: Comparação entre uma solução combinatória e um método de planos
 de corte para o problema do emparelhamento de peso máximo
      
 Bolsa da CAPES (concluída).
   -  André Tadeu de Carvalho
      
 Advisor: Prof. A.P. do Lago
      
 Project's title: Extração de informação
      
   -  Atol Fortin de Oliveira
      
 Advisor: Prof. C.G. Fernandes
      
 Project's title: Teoria dos jogos algorítmica
      
 Bolsa da FAPESP.
      
   -  Camila Mari Matsubara
      
 Advisor: Prof. J. Coelho de Pina
      
 Project's Title: O problema da coleta de prêmios (provisório)
      
   -  César Gamboa Machado
      
 Advisor: Prof. J. Coelho de Pina
      
 Project's Title: Teoria dos jogos algorítmica
      
 Bolsa da CAPES. 
      
   -  Guilherme Puglia Assunção
      
 Advisor: Prof. C.E. Ferreira
      
 Project's title: Representações duais retangulares de
      grafos planares
      
 Bolsa do CNPq.
   -  Gustavo Akio Tominaga Sacomoto
      
 Advisor: Prof. A.P. do Lago
      
 Project's title: Árvores de sufixos: caracterização, combinatória, extensões e aplicações
      
 Bolsa da CAPES. 
      
   -  Joel Silva Uchoa
      
 Advisor: Prof. C.E. Ferreira
      
 Project's Title: Caminhos mínimos com restrições
      
 Bolsa da CAPES (concluída).
   -  Leonardo Marchetti
      
 Advisor: Prof. C.G. Fernandes
      
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   -  Letícia Gindri
      
 Advisor: Prof. N. Kobayashi
      
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   -  Marcelo de Rezende Martins
      
 Advisor: Prof. A.P. do Lago
      
 Project's title: Estudo exploratório em métodos imunológicos para deteção de fraude
      
 Bolsa do CNPq (concluída).
   -  Marli Aparecida Guarino 
      
 Advisor: Prof. A.P. do Lago
      
 Project's title: Análise de regressão em dados clínicos
      
   -  Murilo Santos de Lima
      
 Advisor: Prof. C.G. Fernandes
      
 Project's title: Aproximação de métricas arbitrárias por métricas arbóreas e aplicações
      
 Bolsa do CNPq.
      
   -  Paulo Victor Teixeira Eufrasio
      
 Advisor: Prof. Y. Kohayakawa
      
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 Bolsa da CAPES.
   -  Pedro Henrique Simões de Oliveira
      
 Advisor: Prof. C.E. Ferreira
      
 Project's Title: Estudo do problema de dimensionamento de lotes
   -  Rafael da Ponte Barbosa
      
 Advisor: Prof. Y. Wakabayashi
      
 Project's title: Problemas de cobertura por sensores
      
 Bolsa da FAPESP.
      
   -  Raphael Henrique Ribas
      
 Advisor: Prof. C.G. Fernandes
      
 Project's title: Branch and bound para problemas de escalonamento
      
 Bolsa do CNPq.
      
   -  Roberto Freitas Parente
      
 Advisor: Prof. Y. Kohayakawa
      
 Project's title: Orientações de grafos
      
 Bolsa do CNPq.
   -  Tássia Camões Araujo
      
 Advisor: Prof. A. Mandel
      
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 Bolsa do CNPq.
      
   -  Tharsis Tuani Pinto Souza
      
 Advisor: Prof. Y. Wakabayashi
      
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   -  Thiago Serra Azevedo Silva
      
 Advisor: Prof. Y. Wakabayashi
      
 Project's title: Programação com restrições aplicada a um
      problema de escalonamento com movimentação de recursos e
      administração de inventário
   -  Wanderley Guimarães 
      
 Advisor: Prof. Y. Wakabayashi
      
 Project's title: Conjuntos dominantes em grafos
 
Former Post-docs
  -  Carlos Hoppen, PhD, University of Waterloo 
      Project's title: A análise de estruturas discretas de grandes
      proporções 
      Supervisor: Prof. Y. Kohayakawa 
      Post-doc scholarship from FAPESP, March 2008 to February 2010. 
      Currently at UFRGS. 
      
  
 -  Christiane Neme Campos, Dr., Universidade Estadual de Campinas 
      Project's title: Aspectos teóricos, estruturais e de otimização
      de alguns problemas em grafo 
      Supervisor: Prof. Y. Wakabayashi 
      Post-doc scholarship from FAPESP, April 2007 to January 2009. 
      Currently at IC-UNICAMP. 
     
  
 -  Frédéric Chataigner, Dr., Université Paris 7 
      Project's title: Approximation Algorithms, Complexity and
      Non-Approximability of Problems on Graphs
      Supervisor: Prof. Y. Wakabayashi 
      PosDoc scholarship from FAPESP, September 2005 to September 2006. 
  
 -  Jozef Skokan, PhD, Emory Univ. 
      Project's title: Applications of the Regularity Method
      NSF Fellowship (International Research Fellowship Program), USA
 
      From October 2003 - March 2005, and PosDoc FAPESP, from April
      2005 to June 2006. 
      Currently at the London School of Economics. 
  
 -  Maya Stein, Dr. rer. nat., Universität Hamburg 
      Project's title: Finite and Infinite Problems in Graph
      and Hypergraph Theory 
      Post-doc scholarship from FAPESP, October 2005 to October 2008. 
      Currently at CMM, Universidad de Chile, Santiago. 
 
    
Former  PhD Students
  -  André Fujita, PhD.,
      USP - 2007 (Primeiro lugar no CTD'08, Prêmio
      CAPES de Tese, 2008 - Menção Honrosa)
      
 Advisor: Prof. C.E. Ferreira
      
 Thesis' title: Análise de dados de expressão gênica:
      normalização de microarrays e modelagem de redes regulatórias
      
 Currently at DCC-IME-USP. 
      
   -  Augusto Fernandes Vellozo, PhD., USP - 2007
      
Advisor: Prof. A.P. do Lago
      
Thesis' title: Alinhamento de seqüências com rearranjos
      
Currently doing a PosDoc at Université Claude Bernard, Lyon 1. 
   -  Estela Maris
  Rodrigues, PhD., USP - 2003
      
 Advisor: Prof. Y. Wakabayashi
      
 Thesis' title:  Algoritmos para Comparação de Árvores
      Filogenéticas e o Problema dos Pontos de Recombinação 
      
 Currently at Mackenzie/SP.
      
   -  Fábio H. Viduani
      Martinez, PhD., USP - 2004 
      
 Advisor: Prof. J.A. Soares
      
 Thesis's title: Aproximações para Restrições do Problema de
      Steiner em Grafos 
      
 Currently at DCT-UFMS.
      
   -  Flávio Keidi Miyazawa,
  Ph.D., USP - 1997 
      
 Advisor: Prof. Y. Wakabayashi
      
 Thesis' title: Algoritmos de Aproximação para Problemas de
      Empacotamento (Primeiro lugar no CTD'98)
      
 Currently at IC-UNICAMP.
   -  Gerardo Valdisio Rodrigues Vianna, PhD., UFC - 2007
      
 Co-Advisor: Prof. C.E. Ferreira
      
 Thesis' title: Técnicas para construção de árvores
      filogenéticas
      
 Currently at UFC and UECE. 
      
   -  Glauber Ferreira
      Cintra, PhD., USP - 2004
      
 Advisor: Prof. Y. Wakabayashi
      
 Thesis' title: Algoritmos para Problemas de Corte de
      Guilhotina Bidimensional
      
 Currently at Faculdade 7 de Setembro, Ceará.
      
   -  Gordana Manic,
      PhD., USP - 2006 
      
 Advisor: Prof. Y. Wakabayashi
      
 Thesis's title: Empacotamento de Subgrafos em Grafos
      (Prêmio Capes de Teses de Doutorado 2007)
      
 Currently at UFABC.
   -  Jair Donadelli Júnior, PhD, USP
      - 2002 
      
 Advisor: Prof. Y. Kohayakawa
      
 Thesis' title: Resultados de Ramsey e de Densidade para
      Grafos Pseudo-Aleatórios Esparsos Pseudo-Aleatórios Esparsos 
      
 Currently at DI-UFPR.
      
   -  Liliane Rose Benning
      Salgado, PhD., USP - 2004 
      
 Advisor: Prof. Y. Wakabayashi
      
 Thesis' title: Algoritmos de Aproximação para Partições Conexas em Grafos 
      
 Currently at DI-UFPE.
      
   -  Marco Aurélio Stefanes,
      PhD, USP - 2003 
      
 Advisor: Prof. J.A. Soares
      
 Thesis' title: Algoritmos Paralelos de Granularidade
      Grossa em Grafos Bipartidos Convexos 
      
 Currently at DCT-UFMS.
   -  Orlando Lee, PhD, USP
      - 1999 
      
 Advisor: Prof. Y. Wakabayashi
      
 Thesis's title: Cobertura por Circuitos em Grafos Mistos 
      
 Currently at IC-UNICAMP.
   -  Pavlos Bahia Konstadinidis, MSc., USP
      
 Advisor: Prof. Y. Kohayakawa
      
 Project's title: Tópicos em combinatória
      
 Bolsa do CNPq.
      
   -  Renato J. da S. Carmo,
      PhD., USP - 2005 , PhD., USP - 2005 (Segundo lugar no CTD'05)
      
 Advisor: Prof. Y. Kohayakawa 
      
 Thesis's title: Dois Problemas de Busca.
      
 Currently at DI-UFPR.
      
   -  Rudini Menezes Sampaio 
      
 Advisor: Prof. Y. Kohayakawa
      
 Project's title: Limites de seqüências de permutações
   -  Said Sadique Adi,
      PhD., USP - 2005
      
 Advisor: Prof. C.E. Ferreira
      
 Thesis's title: Montagem de Fragmentos de DNA
      
 Currently at DCT-UFMS.
 
 
Former  MSc Students
  -  Alexandre Noma, MSc., USP - May/03 
      
 Advisors: Prof. J.C. de Pina and Prof. C.G. Fernandes
      
 Dissertation's title: Algoritmos de Planaridade em Grafos
      
   -  Alexandre Scalzitti, MSc., USP - October/99 
      
 Advisor: Prof. Y. Kohayakawa
      
 Dissertation's title: Convergência na Teoria dos Grafos Aleatórios
   -  Álvaro Junio Pereira Franco, MSc., USP - June/09
      
 Advisor: Prof. C.E. Ferreira
      
 Project's title: Algoritmos e estruturas de dados para
      buscas em janelas
   -  Ana Lúcia Lima Marreiros, MSc., USP - August/03 
      
 Advisor: Prof. J.C. de Pina
      
 Dissertation's title: Método Primal-Dual
   -  Andrea Tieme Nakasato, MSc., USP - April/08 
      
 Advisor: Prof. Y. Wakabayashi
      
 Dissertation's title: Ordenação por reversão
   -  Antonio João Ferreira Francisco, MSc., USP - March/06
      
 Advisor: Prof. C.E. Ferreira
      
 Project's title: Algoritmos de aproximação para o projeto de redes
      seguras
      
   -  Aritanan Borges Garcia Gruber, MSc., USP - March/01 
      
 Advisor: Prof. C.E. Ferreira
      
 Dissertation's title: Algoritmos e Estruturas de Dados para
      Problemas em Grafos Dinâmicos
   -  Armando Ramos Gouveia, MSc., USP - November/98 
      
 Advisor: Prof. Y. Kohayakawa
      
 Dissertation's title: Provas Holográficas de Tamanho Quase-linear
   -  Bruno Leite, MSc., USP - December/04
       
 Advisor: Prof. Y. Kohayakawa
      
 Dissertation's title: Versões probabilísticas de alguns resultados da
      teoria combinatória dos números
      
    -  Carlos Henrique Cardonha, MSc., USP - September/06
      
 Advisor: Prof. C.G. Fernandes
      
 Dissertation's title: Sistemas Interativos de Prova Clássicos e Quânticos
      
   -  Carlos R. Pantaleon Dionisio, MSc., USP - February/00
      
 Advisor: Prof. J.C. de Pina
      
 Dissertation's title: Geometria Computacional de Pontos em Movimento
   -  Cássio Polpo de Campos, MSc., USP - December/00
      
 Advisor: Prof. C.E. Ferreira
      
 Dissertation's title: Algoritmos Dinâmicos em Geometria Computacional
      
   -  César Alberto Bravo Pariente, MSc., USP - November/96 
      
 Advisor: Prof. Y. Kohayakawa
      
 Dissertation's title: Um Método Probabilístico em Combinatória
   -  Christian Tjandraamadja, MSc., USP - July/10
      
 Advisor: Prof. C.E. Ferreira
      
 Dissertation's title: Subseqüência comum mais longa sem
      repetições e variantes
   -  Cristiane Maria Sato, MSc., USP - April/08
      
 Advisor: Prof. Y. Kohayakawa
      
 Dissertation's title: Homomorfismos de grafos
      
   -  Daniel Morgato Martin, MSc., USP - July/05
      
 Advisor: Prof. Y. Kohayakawa
      
 Dissertation's title: Coloração de Grafos e o Método Probabilístico
      
   -  Domingos Dellamonica Júnior, MSc., USP - March/07
      
 Advisor: Prof. Y. Kohayakawa
      
 Dissertation's title: Extração de aleatoriedade a partir de fontes defeituosas
   -  Domingos Soares Neto, MSc., USP - September/08
      
 Advisor: Prof. J.A. Soares
      
 Dissertation's title: Filtros para a busca e extração de
      padrões aproximados em cadeias biológicas
      
   -  Edésio R. Sibrão, MSc., USP - December/99 
      
 Advisor: Prof. C.E. Ferreira
      
 Dissertation's title: Escalonamento em Sistemas de Produção: um Estudo
      de Caso
   -  Eduardo Garcia de Freitas, MSc., USP - December/00 
      
 Advisor: Prof. C.E. Ferreira
      
 Dissertation's title: Algoritmos Cinéticos em Geometria Computacional
      
   -  Eduardo Kazuaki Gondo, MSc., USP - May/02 
      
 Advisor: Prof. C.G. Fernandes 
      
 Dissertation's title: Árvores k-Restritas e Algoritmos de
      Aproximação para Árvores de Steiner
   -  Eduardo Tengan, MSc., USP - May/02
      
 Advisor: Prof. A. Mandel 
      
 Dissertation's title:  Automorfismo de Grafos
      
   -  Eider Silva de Oliveira, MSc., USP - August/06 
      
 Advisor: Prof. A. Mandel
      
 Dissertation's title: Sistema de arquivos especializado para correio eletrônico
   -  Estela Maris Rodrigues, MSc., USP - February/97 
      
 Advisor: Prof. M.A. Gurgel
      
 Dissertation's title: Fatores e Empacotamentos em Grafos
   -  Fábio Pisaruk, MSc., USP - February/09
      
 Advisor: Prof. J.C. de Pina
      
 Dissertation's title: k-caminhos mínimos
   -  Fabricio Siqueira Benevides, MSc., USP - March/07 
      
 Advisor: Prof. Y. Kohayakawa
      
 Dissertation's title: Teoria de Ramsey para circuitos e caminhos
      teoria de Ramsey para grafos
    
   -  Fernando Mário de Oliveira Filho, MSc., USP - June/05 (Primeiro lugar no CTD'05)
      
 Advisor: Prof. C.E. Ferreira
      
 Dissertation's title: O problema de Steiner com grupos
   -  Francisco Elói Soares de Araújo, MSc., USP - August/98
      
 Advisor: Prof. J.A. Soares
      
 Dissertation's title: Rearranjo de Genomas por Reversões
   -  Glauber Ferreira Cintra, MSc., USP - July/98 
      
 Advisor: Prof. Y. Wakabayashi
      
 Dissertation's title: Algoritmos Híbridos para Problemas de Corte
      Unidimensional (Primeiro lugar no VI Concurso CLEI/UNESCO'99)
   -  Gordana Manic, MSc., USP - October/01
      
 Advisor: Prof. P. Feofiloff
      
 Dissertation's title: Colorações Restritas de Grafos
      
   -  Hammurabi das Chagas Mendes, MSc., USP - August/08
      
 Advisor: Prof. C.G. Fernandes
      
 Dissertation's title: Estruturas de Dados Concorrentes:
      um Estudo de Caso em Skip Graphs
   -  Jair Donadelli Júnior, MSc., USP - March/96
      
 Advisor: Prof. Y. Kohayakawa
      
 Dissertation's title: Arranjos de Subespaços, Colapso de
      Complexos Simpliciais e Complexidade Computacional
            
   -  José Osvaldo Couto Horta, MSc., USP - October/01
      
 Advisor: Prof. J.C. de Pina
      
 Dissertation's title: Estimativas de Entropia para Seqüências de DNA
      
   -  Juliana Barby Simão, MSc., USP - March/09
      
 Advisor: Prof. J.C. de Pina
      
 Dissertation's title: Submodularidade em otimização combinatória
   -  Lennon de Almeida Machado, MSc., USP - January/10
      
 Advisor: Prof. A.P. do Lago
      
 Dissertation's title: Busca indexada de padrões em textos comprimidos
   -  Luiz Carlos Rozante, MSc., USP - January/02 
      
 Advisor: Prof. J.A. Soares 
      
 Dissertation's title: Algoritmos para Predição de Estrutura
      Secundária do RNA
 
   -  Luiz Daniel Creão Augusto, MSc., USP - March/10
      
 Advisor: Prof. A.P. do Lago
      
 Dissertation's title: 
   -  Manoel Fernando Alonso Gadi, MSc., USP - April/08 
      
 Advisor: Prof. A.P. do Lago.
      
 Dissertation's title: Uma comparação de métodos de
      classificação aplicados à detecção de fraude em cartões de crédito
      
   -  Marcel Kenji de Carli Silva, MSc., USP - April/07
      
 Advisor: Prof. Y. Wakabayashi
      
 Dissertation's title: Relações min-max em otimização combinatória
      
   -  Marcelo Hashimoto, MSc., USP - February/07
      
 Advisor: Prof. J.C. de Pina
      
 Dissertation's title: Bases de Hilbert
   -  Marcio Takahashi Iura Oshiro, MSc., USP - May/10
      
 Advisor: Prof. J.C. de Pina
      
 Dissertation's title: k-árvores de custo mínimo
   -  Marco Aurélio Stefanes, MSc., USP - February/98 
      
 Advisor: Prof. J.A. Soares 
      
 Dissertation's title: Algoritmos e Implementações Paralelas para
      Florestas Geradoras Mínimas
   -  Márcio Grossi de Almeida, MSc., USP - June/00 
      
 Advisor: Prof. Y. Kohayakawa
      
 Dissertation's title: Números de Ramsey Induzidos e Semi-induzidos
   -  Mário Leston Rey, MSc., USP - November/99
      
 Advisor: Prof. P. Feofiloff
      
 Dissertation's title: T-Junções, T-cortes e Funções Conservativas
   -  Marko Loparic, MSc., USP - January/96 
      
 Advisor: Prof. C.E. Ferreira
      
 Dissertation's title: Uma Aplicação do Método de Branch and Cut a um
      Problema de Roteamento de Veículos (Segundo lugar
      no CTD'97)
   -  Mauricio Silva de Moura, MSc., USP - February/09
      
 Advisor: Prof. J.C. de Pina
      
 Dissertation's title: Método de Robertson-Seymour para caminhos disjuntos
      
   -  Nelio Alves Pereira Filho, MSc., USP - August/04
      
 Advisor: Prof. A. Mandel
      
 Dissertation's title: Serviços de Pertinência para Clusters de Alta Disponibilidade
      
   -  Pavlos Bahia Konstadinidis, MSc., USP - February/05.
      
 Advisor: Prof. Y. Kohayakawa
      
 Dissertation's title: Grafos distância
   -  Rafael Pereira Luna, MSc., USP - April/06
      
 Advisor: Prof. C.G. Fernandes
      
 Dissertation's title: Implementações do método de
      aproximação primal-dual aplicado ao problema da floresta de
      Steiner
   -  Rafael Plana Maranzato, MSc., USP - March/10
      
 Advisor: Prof. A.P. do Lago
      
 Dissertation's title: Identificação de fraude no mercado de transações online
   -  Renato da Silva Carmo, MSc., USP, 94 (Primeiro lugar no CTD'95)
      
 Advisor: Y. Wakabayashi
      
 Dissertation's title: O Problema do Subgrafo Planar Ótimo
      
   -  Renato Pinheiro Freme Lopes Lucindo, MSc., USP - March/07
      
 Advisor: Prof. Y. Wakabayashi
      
 Project's title: Partição de Grafos em Subgrafos Conexos
      Balanceados
      
   -  Rodrigo Souza de Castro, MSc., USP - June/03
      
 Advisor: Prof. A.P. do Lago
      
 Dissertation's title: Cache comprimido adaptativo: estudo, projeto e implementação
      
   -  Rogério Theodoro Brito, MSc., USP - September/03
      
 Advisor: Prof. J.A. Soares 
      
 Dissertation's title: Alinhamento de Múltiplas Seqüências
   -  Said Sadique Adi, MSc., USP - April/00 
      
 Advisor: Prof. C.E. Ferreira
      
 Dissertation's title: Ferramentas de Auxilio ao
      Sequenciamento de DNA por montagem de fragmentos: um estudo
      comparativo
      
   -  Shigueo Isotani, MSc., USP - April/02
      
 Advisor: Prof. J.C. de Pina
      
 Dissertation's title:  Algoritmos para Caminhos Mínimos 
   -  Wendel Scardua, MSc., USP - March/09
      
 Advisor: Prof. A.P. do Lago
      
 Dissertation's title: Métodos de Aprimoramento de Resultados em
      Sistemas de Recuperação de Informação
 
Last modified: Wed Aug 25 15:33:31 BRT 2010